Les défis :

Quelques-uns des défis du Web sémantique sont l'immensité, l'imprécision, l'incertitude, l'incohérence, et la tromperie. Les systèmes de raisonnement automatisé devront faire face à toutes ces questions, afin d'être à la hauteur de la promesse du Web sémantique.

• Immensité : Le World Wide Web contient plusieurs milliards de pages. L'ontologie de la terminologie médicale SNOMED CT contient à elle seule 370 000 noms de classes, et aucune technologie existante n'a été encore en mesure d'éliminer tous les doublons du point de vue sémantique de cette ontologie. À l’avènement du Web sémantique, tous les systèmes de raisonnement automatisé devront alors gérer une quantité de paramètres vraiment énormes.
• Imprécision : Il existe des notions imprécises comme « jeune » ou « grand ». Ceci découle de l'imprécision des requêtes des utilisateurs qui s'alignent sur les termes utilisés par les fournisseurs de contenu. Les fournisseurs ayant des bases de connaissances qui se chevauchent, recréent cependant différents concepts avec des différences subtiles. La logique floue est la technique la plus courante pour faire face à l'imprécision.
• Incertitude : Ce sont des concepts précis avec des valeurs incertaines. Par exemple, un patient peut présenter un ensemble de symptômes qui correspondent à un certain nombre de diagnostics différents, chacun avec une probabilité différente. Les techniques de raisonnement probabiliste sont généralement employés pour traiter l'incertitude.
  
• Incohérence : Ce sont des contradictions logiques qui surgiront inévitablement au cours du développement des grandes ontologies, et quand les ontologies à partir de sources distinctes seront combinées. Le raisonnement déductif échouera face à cette incohérence parce que d'une contradiction on peut en déduire n'importe quoi (principe d'explosion). Le raisonnement révisable et le raisonnement paraconsistant sont deux techniques qui peuvent être utilisés pour faire face à l'incohérence.
• Tromperie : Cela arrive quand le producteur d'une information désire volontairement tromper le consommateur de ce type d'information. les techniques de cryptographie sont actuellement utilisées pour remédier à cette menace et ainsi veiller à l'intégrité des données.